El segundo tiempo se lo complicó solo Boca. Un planchazo del juvenil Milton Delgado a Renato Ibarra dejó con 10 jugadores al local y el equipo ecuatoriano creció en el trámite del encuentro. El conjunto de Javier Gandolfi se animó a atacar y generó peligro en el área de Sergio Romero.
El delantero Michael Hoyos fue protagonista de los ataques de Independiente del Valle, pero sin mucha eficacia. El Xeneize sacó su oficio y se impuso, con un jugador menos, durante todo el segundo tiempo. Así llegó la victoria de Boca, sin mucho brillo, pero con la contundencia que se necesita en los torneos continentales.
De esta manera, el Xeneize jugará la llave de los octavos de final contra Cruzeiro. La semana del 13 de agosto será el partido de ida, en la Bombonera. El encuentro de vuelta será siete días después, en Brasil.